Het verhaal gaat over een zeemeermin Luchia die toen ze nog klein was een jongetje van een cruiseschip had gered toen hij in zee viel. Op land was hij nog bewusteloos en om zijn leven te redden gaf Luchia hem haar parel, zodat hij het overleven zou. Luchia was op slag verliefd.
Na een aantal jaar keert Luchia terug naar land, want ze moet haar parel zoeken. Zonder parel kan ze namelijk niet prinses worden. Er dreigt ook tijdelijk gevaar in de zee. De zeemeerminnen worden aangevallen door de clan Phantalassa. Dit is een groep zeewezens die voor de helft mens zijn. Hun leider is Gaito, die heeft zijn dienaren gemaakt uit vissen. Om zowel haar rijk te redden als de rest van de zee gaat Luchia naar de mensenwereld, waar ze ook weer Kaito, de jongen die ze eerder had gered, opnieuw ontmoet.
Maar Luchia is ook op het land niet veilig, omdat de wezens zoeken naar Luchia's parel. Dus werd ook Kaito een doelwit, aangezien hij de parel van Luchia bezat. Zo werd hij dus door de zeeheks Izul aangevallen. Dan ziet Kaito Luchia in zeemeermin formaat en hij gooit haar haar parel aan, waardoor ze transformeert in Pink Pearl Mermaid Princess en kon ze Izul verslaan door Legend of Mermaid te zingen.
Luchia heeft gemerkt dat ze helemaal verliefd is geworden op Kaito, maar jammer genoeg voor Luchia heeft Kaito alleen intresse in haar zeemeerminvorm. Daarnaast kan ze het hem ook niet vertellen omdat ze anders in schuim zal veranderen.
In de tussentijd sluiten ook Hanon en Lina zich aan bij Luchia. Samen strijden ze tegen het kwaad, en gaan ze zoeken naar de zeegodin "Aqua Regina-Sama", die hun kan helpen om de zee te zuiveren van het kwade.
Meerdere zeemeerminnen verschijnen, zoals de paarse zeemeermin: Karen. Deze is behoorlijk boos op Lina. Zal het deze zeemeerminprinsessen echt wel lukken samen? Laat staan dat twee van de zeemeerminnen Coco en Noel gevangen zijn door Gaito.
Dit verhaal gaat verder op Pitch. Als je niet wilt weten hoe Pitch eindigt kun je beter wachten met lezen tot je het zelf gezien hebt.
Nadat Gaito verslagen was door de liederen van de zeemeerminnen en Kaito eindelijk wist wie Luchia is, leek alles weer helemaal perfect te zijn. Maar snel genoeg als Kaito naar Hawaii ging begon het pas. Mikeru verscheen. Een engel die alle macht van de zeemeerminnen wil hebben zodat hij zelf sterker wordt. Terwijl Kaito surft in Hawaii krijgt hij een ongeluk met z'n surfbord. Luchia hoort dit en schrikt enorm. Kaito werd gevonden door een meisje Mikaru en die zei dat zij zn vriendin was. En Kaito zou niet weten waarom hij dat niet zou geloven aangezien hij z'n geheugen kwijt was geraakt door het ongeluk.
Als Kaito enemaal weer op school is kan Luchia hem wel van blijdschap omhelsen maar Kaito heeft geen idee wie ze is en dat deed Luchia veel pijn.
Luchia heeft steeds vaker oog in oog gestaan met Seira, de nieuwe Orange Mermaid. Sara vertelde Luchia dat zij ervoor moet zorgen dat Seira geboren kan worden. Maar lukt dit haar wel?
De zeemeerminnen hebben ondertussen ook veel aan hun hoofd gehad de vijanden uit te schakelen. De Black Beauty Sisters waren opeens ook weer verschenen, waarvan de zeemeerminnen wel even stonden te kijken. Dat was Mikeru's werk. Het ergste was nog voor de zeemeerminnen dat ze doorhadden dat KODOU geen effect meer op hun had. En ook niet op de andere vijanden. Maar daarmee konden ze wel Gaito verslaan.
En de zeemeerminnen zijn ook niet compleet, zolang Seira niet geboren is. Nu heeft Luchia de taak om de nieuw verschenen vijanden te verslaan, maar ook om haar belofte aan Sara na te komen en helpen Seira tot leven te wekken. En of dat wel allemaal goed gaat..